La serie gira en torno a las misiones que realiza el personaje principal Angus MacGyver para distintas instituciones, sobre todo para la Fundación Phoenix. En la serie, MacGyver resuelve todos los problemas que se le plantean haciendo uso de su gran inteligencia, su conocimiento académico en ciencias e ingeniería y su habilidad para la construcción de herramientas con elementos cotidianos de su entorno.
Episodio 1 MacGyver es convocado para probar el sistema de seguridad de una investigación y laboratorio de desarrollo. El sistema, que atrapa y extermina intrusos, tiene una falla y deja atrapados en su interior a su creador, Jill Ludlum, y a MacGyver.
Episodio 2 MacGyver está disfrutando jugar en una escaramuza con un equipo profesional de hockey cuando Pete Thornton lo convoca para resolver un caso de espionaje internacional.
Episodio 3 MacGyver, Pete Thornton y Joanne Remmings (el experto en estafas residente de la Fundación Phoenix) arman una operación encubierta contra un estafador que engañó a su amigo para quitarse los ahorros de su vida.
Episodio 4 MacGyver pelea por salvar a un niño pequeño del infausto destino de una leyenda centenaria.
Episodio 5 Cuando el avión se estrella contra la jungla, MacGyver y cuatro jóvenes líderes de una pandilla luchan por sobrevivir.
Episodio 6 Cuando MacGyver acepta rescatar a un viejo amigo, acaba en una misión de rescate en Centroamérica para salvar a otro amigo de los narcotraficantes.
Episodio 7 MacGyver y Pete Thornton viajan al sudeste de Asia para rescatar a un grupo de huérfanos, una monja y el viejo amor de Mac, Debra Easton, cuyas vidas se ven amenazadas por un régimen opresor.
Episodio 8 En un entorno silvestre, MacGyver y Darin Cooper, de 10 años, intervienen para salvar las vidas de unas águilas doradas lastimadas por cazadores furtivos. Estos van tras MacGyver (testigo de su delito) y toman como rehenes a Darin y su madre.
Episodio 9 MacGyver y una sorda maestra de escuela, Carrie Linden, atraviesan una pesadilla cuando se tropiezan con el ingenioso plan de un exagente de la CIA para robar un misil, pieza por pieza, y venderlo en el mercado negro.
Episodio 10 MacGyver pelea contra la mafia mientras protege a una pareja de ancianos que involuntariamente quedan en medio de una operación de falsificación de un grupo delictivo.
Episodio 11 Atrapado dentro de la Fundación Phoenix por parte de un grupo de terroristas, MacGyver se apura frente a una bomba de tiempo para salvar su vida y la de su abuelo.
Episodio 12 MacGyver es la única esperanza de Thorntons cuando son tomados de rehén en los pantanos de Louisiana por un exagente en busca de venganza.
Episodio 13 MacGyver descubre un complot para asesinar a un informante que amenaza con exponer una red de narcotráfico.
Episodio 14 MacGyver pelea con exconvictos para salvar la vida de una mujer y su hijo por nacer.
Episodio 15 MacGyver está tras la pista de ladrones que usan tácticas navales de alto nivel para robar un tesoro del siglo XVIII.
Episodio 16 Mientras están de vacaciones en las laderas, MacGyver y Pete Thornton se convierten en el objetivo de un escuadrón “asesino” de la mafia.
Episodio 17 MacGyver y su vagabundo amigo Jack Dalton están juntos nuevamente: esta vez se enfrentan a un agente de la CIA que se pasó a los malos y sus secuaces, que están traficando documentos ultrasecretos fuera del país.
Episodio 18 MacGyver y Pete Thornton se encuentran exactamente donde estuvieron siete años atrás: enfrentan a un asesino de clase mundial y el más alto nivel a quien creían muerto.
Episodio 19 MacGyver es convocado para rescatar a un piloto estadounidense de cargas que está siendo retenido por cargos de espionaje en Centroamérica.
Episodio 20 
Episodio 21 Una lesión en la cabeza como resultado de una confrontación con asesinos a sueldo que temen que MacGyver sepa demasiado acerca de su complot para asesinar a los líderes de la brigada antiterrorista Omega Force, hace que MacGyver pierda la memoria.
Episodio 22 MacGyver viaja a Checoslovaquia para rescatar a un disidente que se encuentra en la sala de enfermos psiquiátricos de más alta seguridad de un hospital checo.
Richard Dean Anderson
Angus MacGyver
Dana Elcar
Pete Thornton
