La historia de Gintama se sitúa en un Edo alternativo (actual Tokio), conquistado por alienígenas llamados Amanto, quienes prohíben el uso de espadas y debilitan a los samuráis. El protagonista, Gintoki Sakata, es un samurái excéntrico que termina formando el grupo “Yorozuya” junto a Shinpachi, un joven que lo admira, y Kagura, una chica alienígena con fuerza sobrehumana. Juntos trabajan como freelancers resolviendo diversos encargos. A lo largo de la serie interactúan con otros personajes importantes como el grupo policial Shinsengumi, el terrorista idealista Kotaro Katsura y el violento antagonista Shinsuke Takasugi. Aunque la historia principal se desarrolla gradualmente, también contiene sagas que se desvían del argumento central con frecuencia.
Episodio 1 Tras todo lo ocurrido en la anterior temporada, ahora consideran a Gintoki un criminal de los más buscados. Por otra parte, por fin iremos sabiendo un poco más qué ocurre con Utsuro y Shouyou.
Episodio 2 Gintoki, Katsura y Tatsuma se reúnen de nuevo con la intención de ayudar a Shinsuke. Kagura por su parte tiene sus propios planes para proteger a sus dos familias.
Episodio 3 Gintoki y compañía lanzan un ataque directo contra los Harusame para lograr su ansiado objetivo. Por otro lado, Umibouzu sigue buscando a su hijo para acabar con él.
Episodio 4 Katsura el Cobarde se está enfrentando a uno de los miembros de mayor rango de los Piratas Harusame, así que tendrá que sacar todas sus fuerzas. Mientras tanto, Tatsuma está teniendo problemas en su propia nave.
Episodio 5 Tatsuma tiene que hacer frente al maestro de las artimañas, quien tiene controlada no solo su nave, sino a todo el personal que viaja a bordo de ella. Pese a lo despreocupado que es, nunca abandonará a uno de los suyos.
Episodio 6 Mientras la increíble batalla sigue desarrollándose, aparecen dudas sobre quién es aquel personaje que guarda un parecido tan asombroso con Gintoki. ¿Tendrá algo que ver en la historia?
Episodio 7 Por un lado, los discípulos de Shouyou se han unido y están luchando para acabar con la pesadilla. Por otro lado, Umibouzu está dispuesto a acabar de una vez por todas con sus problemas familiares.
Episodio 8 Umibouzu nos hará saber cómo conoció a la misteriosa Señora de Kouan y cómo le otorgaron el título de hombre más fuerte del universo, aunque él diga que no lo es en realidad.
Episodio 9 Kamui nos hace partícipes del verdadero motivo por el cual quería acabar con la vida de su padre y cada vez está más cerca de lograrlo, pese a los intentos de Kagura por evitarlo.
Episodio 10 Ahora que Gintoki se apropió del título de "el más fuerte", tendrá que enfrentarse a Kamui para medir fuerzas y ver cuál de los dos es el más fuerte. Mientras tanto, Kagura asiste al duelo al límite de sus fuerzas.
Episodio 11 El conflicto parece haber terminado en su mayoría y las cosas volverán a una paz temporal, pero no para todos. Takasugi aún tiene que hacer frente a Oboro.
Episodio 12 Finalmente conoceremos el origen de Shouyou Yoshida y Utsuro. Se aproxima la batalla más importante para salvar ya no solo la Tierra, sino el universo entero de la amenaza de Utsuro.
杉田智和
Gintoki Sakata (voice)
釘宮理恵
Kagura (voice)
阪口大助
Shinpachi Shimura (voice)
石田彰
Kotarou Katsura (voice)
立木文彦
Taizou Hasegawa (voice)
中井和哉
Toushirou Hijikata (voice)
鈴村健一
Sougo Okita (voice)
Takehito Koyasu
Shinsuke Takasugi (voice)
甲斐田裕子
Tsukuyo (voice)
日野聡
Kamui (voice)
井上和彦
Oboro
千葉進歩
近藤勋（配音）
くじら
Otose (voice)
高橋美佳子
Sadaharu (voice)
藤原啓治
Hattori, Zenzou (voice)
Tessyo Genda
Hedoro (voice)
青野武
Hiraga, Gengai (voice)
Takumi Yamazaki
Kawakami, Bansai (voice)
成田紗矢香
Ketsuno, Christel (voice)
若本規夫
Matsudaira, Katakuriko (voice)
江川央生
Saigou, Tokumori (voice)
大塚明夫
Saizou (voice)
Miki Shin'ichirou
Sakamoto, Tatsuma (voice)
ゆきのさつき
Shimura, Tae (voice)
Fumiko Orikasa
Yagyuu, Kyuubei (voice)
山寺宏一
Yoshida, Shouyou (voice)
