La historia cubre un lapso de 20 años, mezclando el presente con la evolución de Jin (un chico que queda completamente huérfano, al morir Kanzaki, su padre adoptivo, a manos de un monstruo) con el pasado de Kanzaki (y el misterioso origen de Jin). Jin descubrirá cambios en su interior: una vez que se enfada descubre un cambio en él, que es incapaz de controlar. Mientras, el presidente de la Amagi Corporation está a la búsqueda de un ente llamado ZET, reconocible por una marca circular en su mano. Una vez lo localiza, se inicia una desconcertante investigación por descubrir todos los datos sobre el ZET. La historia se basa en mutantes conocidos como Players (jugadores), quienes tienen al igual que Jin capacidades sobrehumanas, Así con el paso de la historia Jin se va transformando en una especie de superhéroe que lucha contra la injusticia, desafortunadamente también lucha contra su monstruo interior ZET.
Episodio 1 Jin Kanzaki es pobre, pero vive una vida feliz con su abuelo. Junto con sus amigos Kouga y Konoha, ayuda a la gente por una tarifa. Mientras tanto, la policía está buscando a un vicioso asesino en serie.
Episodio 2 Han pasado algunos años desde que Jin desapareció. Kouga, que aún sueña con convertirse en un verdadero héroe, tiene la intención de atrapar a un pirómano en serie que merodea por las calles.
Episodio 3 Cuando Jin se despierta, ve un monstruo que sostiene el cuerpo sin vida de su madre adoptiva, Akemi. Un anciano llamado Mitsugai está intentando despertar a ZET dentro de Jin usándola. Mitsugai tiene éxito y ZET despierta... pero aún está incompleto.
Episodio 4 Han pasado dos años. Los jugadores están causando estragos en la sociedad, pero los humanos aún desconocen su existencia. La gente vive con miedo y Mitsugai no puede producir otro ZET.
Episodio 5 Kouga intenta convertirse en un superhéroe creando Alphas de la vida real. Un hombre misterioso se le acerca con una prueba para ver si está calificado para convertirse en uno.
Episodio 6 Konoha es tomada como rehén y Jin no puede hacer nada. A diferencia de antes, no puede convertirse en ZET lastimándose a sí mismo y no tiene su chicle de activación.
Episodio 7 ZET finalmente se vuelve rojo y muestra poderes como nunca antes se había visto. Con una fuerza abrumadora, ZET domina la lucha contra un jugador. Mientras tanto, Kouga está teniendo dificultades para defenderse de un jugador en su primera batalla como alfas.
Episodio 8 Kouga se entera de que Jin ha estado luchando solo como ZET. Emocionado por conocer a un verdadero héroe, Kouga lo llama "ZETMAN" y declara que luchará junto a él. Jin y Kouga se dirigen al laboratorio para averiguar por qué Red ZET se volvió blanco.
Episodio 9 La clave para completar ZET es el colgante que Konoha tiene en su poder. Haitani y sus hombres se infiltran fácilmente en la residencia Amagi. Konoha se despierta y encuentra a Jin parado frente a ella. Ella le entrega el colgante, sin saber que en realidad es un clon.
Episodio 10 Konoha desaparece. Kouga recibe una llamada telefónica del hombre que le dio la primera prueba en la que tuvo que elegir entre la vida de su hermana o tres chicas de secundaria que no conocía. Kouga eligió a Konoha y las chicas fueron asesinadas.
Episodio 11 Haitani secuestra una señal de transmisión en Middletown para declarar la guerra contra la humanidad. Bajo su liderazgo, los jugadores retrocedidos comienzan a causar estragos, pero Jin aparece como ZET para proteger a las personas y lucha como un ejército de un solo hombre.
Episodio 12 Dentro de la Torre Amagi, ZET es gravemente herido por Haitani y ya no puede conservar su forma. ¿Tiene que volverse completo para derrotar a Haitani? ¿Por qué Haitani quiere que ZET esté completo tan desesperadamente?
Episodio 13 Jin recorre un camino sangriento en soledad como ZET - Alphas ha cumplido su sueño de convertirse en héroe y lucha de acuerdo a su idea de justicia - Después de tanta sangre y lágrimas, ¿qué es lo que querían lograr al final?
浪川大輔
Jin Kanzaki (voice)
Romi Park
Jin Kanzaki (young) (voice)
伊瀬茉莉也
Hanako Tanaka (voice)
宮野真守
Kouga "Alphasz" Amagi (voice)
甲斐田ゆき
Kouga "Alphasz" Amagi (young) (voice)
花澤香菜
Konoha Amagi (voice)
遊佐浩二
Seiji "Anvil" Haitani (voice)
