Se centra en dos agentes federales enviados al misterioso Almacén 13, en Dakota del Sur, donde el gobierno guarda, bajo el más absoluto secreto, todo tipo de artefactos extraños.
Episodio 1 En el estreno de la segunda temporada, retomamos justo donde lo dejamos. MacPherson ha hecho añicos a Artie y ha desaparecido. ¿Leena es realmente una traidora? ¿A dónde se ha ido Claudia? ¿Cómo será Pete?, ¿Myka y el almacén se van sin Artie? ¿Qué otros estragos causó MacPherson cuando estaba solo en el Almacén? ¿Y hay todavía un nuevo villano en el horizonte?
Episodio 2 Un vigilante superpoderoso anda suelto por Detroit y los agentes intentan localizar al responsable. Mientras tanto, las cosas entre Leena y Claudia todavía están tensas, y Artie está obsesionado por el espíritu de su amigo muerto.
Episodio 3 Cuando un artefacto destinado al Almacén aparece en la pequeña ciudad de al lado, el equipo se encuentra en medio de un colapso de una película de serie B con vaqueros, gladiadores, robots de ciencia ficción e infantes de marina que asaltan la playa. Su única posibilidad de supervivencia reside en el hombre que inventó la televisión, Philo T. Farnsworth.
Episodio 4 Cuando las supermodelos jóvenes envejecen rápidamente 50 años de la noche a la mañana, Pete y Myka se infiltran en el glamoroso mundo de la alta costura para descubrir quién, y qué, está detrás de las transformaciones.
Episodio 5 Douglas Fargo de Eureka's Global Dynamics es enviado al Almacén 13 para ayudar a actualizar su antiguo sistema informático. Esto desencadena un virus informático aparentemente sensible que envía el almacén a un bloqueo y atrapa al equipo dentro.
Episodio 6 La Sra. Frederick recluta en secreto a Pete para encontrar un topo dentro de la organización que está comprando artefactos. Sin embargo, cuando el topo se entera, van tras los más cercanos a Pete.
Episodio 7 Claudia acaba de recibir su primera tarea, pero cuando se trata de una antorcha humana real y H.G. Wells, ¿podría ser demasiado para ella? Sin mencionar la aparición de un viejo amor de Artie.
Episodio 8 Los agentes esperan pasar un fin de semana relajándose hasta que un artefacto se interpone en su camino.
Episodio 9 Alguien está usando los artefactos de Artie para cometer una serie de asesinatos.
Episodio 10 Pete y Myka usan la máquina del tiempo de H.G. Wells para viajar de regreso a 1961.
Episodio 11 
Episodio 12 
Episodio 13 
Eddie McClintock
Pete Lattimer
Joanne Kelly
Myka Bering
Saul Rubinek
Arthur "Artie" Nielsen
Allison Scagliotti
Claudia Donovan
Aaron Ashmore
Steve Jinks
