El lado oscuro y los secretos del pueblo cobran mayor relevancia en la investigación del agente Cooper sobre el asesinato de Laura Palmer. A medida que se revelan los increíbles detalles, lo arriesga todo para descubrir la verdad, incluso su propia alma.
Episodio 1 Herido, el agente Cooper tiene una visión de un gigante que le brinda varias pistas sobre el asesinato de Laura Palmer. Shelly y Pete se recuperan del incendio en el aserradero, pero Josie y Catherine están desaparecidas.
Episodio 2 Albert determina que ni Leo ni Jacques mataron a Laura, pero no consigue pistas para descubrir quién le disparó a Cooper. Cooper dice que deben encontrar al tercer hombre y piensa que se trata de Bob, el hombre de cabello canoso.
Episodio 3 Ronette es atacada en su cama del hospital por una persona no identificada. Jean Renault, hermano de Jacques y Bernard, planea chantajear a Ben Horne a cambio de liberar a Audrey. Donna se reúne con Harold Smith, un hombre que jamás sale de su casa y que entabló amistad con Laura.
Episodio 4 Leland confiesa haber matado a Jacques Renault. Andy quiere hacerse un nuevo espermiograma. Se corre el rumor de que un crítico gastronómico llegará a Twin Peaks. Jean le pide a Ben que le tienda una trampa a Cooper a cambio de la vida de Audrey.
Episodio 5 Cooper descubre que olvidó el mensaje que estaba bajo su cama. Shelly y Bobby comienzan a cuidar a Leo en casa. Sternwood escucha los alegatos previos al juicio y declara que Leo no es apto para ser juzgado. Nadine regresa a casa pensando que aún está en la preparatoria.
Episodio 6 James salva a las chicas de un atormentado Harold. Cooper lleva a Audrey a casa. Bobby y Shelly descubren que su plan para cobrar el seguro resulta contraproducente. Donna intenta convencer a Truman de que Harold Smith tiene el diario secreto de Laura.
Episodio 7 Cooper y el hombre con un solo brazo inspeccionan a los huéspedes del Gran Hotel del Norte. Hawk encuentra a Harold Smith muerto, con una misteriosa nota de suicidio y el diario destrozado. Leo le habla a Bobby sobre unos “zapatos nuevos”.
Episodio 8 Donna y James se preguntan por qué Maddy se marchó tan repentinamente. La madre de Norma llega con la noticia de que se casó con un nuevo hombre, Ernie Niles. Cooper le dice a Leland que arrestaron a Ben Horne por el asesinato de Laura.
Episodio 9 Albert regresa para examinar a Maddy. Cooper pide veinticuatro horas para resolver el caso. James y Donna reafirman su amor. Accidentalmente, Andy lleva a Donna y a Cooper de regreso a la casa de la Sra. Tremond.
Episodio 10 Leland es enterrado y Sarah Palmer intenta aceptar todo lo que le ha pasado a su familia. El Dr. Jacoby regresa de Hawái. Cooper se prepara para marcharse de Twin Peaks. El alcalde Milford se opone al compromiso de su hermano con una mujer joven.
Episodio 11 La Sra. Briggs habla sobre la desaparición de su esposo en el bosque. Nadine entra al equipo de lucha y se enamora de Mike Nelson. James es contratado por la acaudalada y misteriosa Evelyn Marsh. Dick acoge a un huérfano, el pequeño Nicky.
Episodio 12 Ben toma a Bobby bajo su protección con la esperanza de acabar con Hank y Jean. Sin embargo, el estado mental de Ben comienza a venirse abajo. Cooper empieza a buscar inmuebles en venta. El supervisor del comandante Briggs revela que este estudiaba el bosque.
Episodio 13 El comandante Briggs no recuerda el lugar a donde fue llevado en su abducción, pero ahora tiene un peculiar tatuaje en el cuello. Andy y Dick investigan sin permiso los archivos del pequeño Nicky. Mike y Nadine comienzan una aventura. Evelyn le pide a James que mate a su esposo.
Episodio 14 Windom Earle ha cobrado su primera víctima en un mortal juego de ajedrez. Audrey le dice a Bobby que tienen que salvar a Ben de su fantasía con la Guerra Civil. Leo despierta y ataca a Shelly, pero Bobby consigue defenderla.
Episodio 15 La policía busca a James por el asesinato de Marsh. Bobby y Shelly le dicen a Truman que Leo escapó y Bobby revela que vio que Hank le disparó a Leo la noche del incendio en el aserradero. Albert regresa a Twin Peaks con información acerca de Windom Earle.
Episodio 16 Truman mete a Hank a la cárcel por el intento de asesinato de Leo, mientras que Hank señala a Josie por el asesinato de Andrew Packard. Albert revela que fue Josie quien le disparó a Cooper. Ben recluta a John Justice Wheeler para que le ayude a detener los planes en Ghostwood.
Episodio 17 Tras la muerte de Josie, Harry se hunde en una profunda depresión. El cadáver de Josie ofrece más preguntas que respuestas. La atormentada hermana de Norma, Annie, llega a Twin Peaks. Wheeler y Audrey se sienten atraídos mutuamente. Earle enfurece por las tablas por rey ahogado que consigue Cooper.
Episodio 18 Harry es atacado por Jones mientras duerme. Audrey y Wheeler comienzan una relación. Gordon Cole regresa con un reporte que indica que Windom Earle trabajó junto al comandante Briggs en el Proyecto Libro Azul. Cole reincorpora a Cooper en el FBI.
Episodio 19 Cooper y los demás encuentran el petroglifo misterioso. Windom Earle establece amistad con un joven rocanrolero y le cuenta historias sobre unos sitios llamados la Guarida Blanca y la Guarida Negra. Pete ayuda a Catherine a abrir la primera caja-rompecabezas.
Episodio 20 Bobby y Shelly reafirman su amor. Cooper reúne a Shelly, Donna y Audrey para advertirles acerca de Earle. Briggs le muestra a Cooper un video de Windom Earle donde da un reporte sobre su misión para descubrir la Guarida Negra.
Episodio 21 Windom Earle pone su mira en el concurso de Miss Twin Peaks. Lucy escoge a un padre para su bebé. Leo es castigado cuando libera al comandante Briggs. Cooper encuentra la llave para abrir el portal que lleva a la Guarida Negra. Annie y Dale establecen un compromiso.
Episodio 22 El agente Cooper sigue a Windom Earle y a Annie hacia las profundidades de la Guarida Negra. Big Ed y Norma reciben una sorpresa cuando Nadine se golpea la cabeza. Andrew y Pete abren la última caja de Eckhardt y Audrey lleva a cabo un acto de desobediencia civil.
Kyle MacLachlan
Dale Cooper / Dougie Jones
