Episodio 1 Pánico con palomitas / Desaparecido
Los pingüinos pierden el acceso a su comida favorita, las palomitas de maíz/ Maurice está cansado de seguir las órdenes de Julien y de vivir con él.
Skipper, Kowalski, Rico y Cabo parecen pingüinos de zoológico normales, ¡Pero en realidad son una fuerza de ataque de élite con un cuartel general secreto que quiere orden! Y el Rey Julien, autoproclamado "Rey de los Lémures", quiere cambiar eso.
Episodio 1 Los pingüinos pierden el acceso a su comida favorita, las palomitas de maíz/ Maurice está cansado de seguir las órdenes de Julien y de vivir con él.
Episodio 2 El zoológico instala cámaras web para atraer visitantes y Cabo se vuelve una estrella de internet. / El rey pierde su corona y Skipper y los demás deben encontrarla.
Episodio 3 Hartos de la irritante presencia de Julien, los pingüinos toman unas vacaciones a la luna y conocen a un "gato lunar" con sed de nuevos amigos. / Cuando un extraño sonido despierta a Marlene, los pingüinos buscan su origen.
Episodio 4 Cuando los muñecos de peluche de Mort se vuelven populares en el zoológico, Julien se pone celoso y hace que regresen a la fábrica. / Maurice soborna con dulces a los animales del zoológico para que celebren el día del rey Julien.
Episodio 5 Cuando Marlene encuentra un huevo, los pingüinos se preparan para cuidarlo. / Cuando el Rey Julien se excede con su estéreo, Skipper le roba las baterías. En la persecución subsecuente, terminan atrapados en el hábitat.
Episodio 6 ¡Es increíble! El Rey Julien gana todos los juegos contra los pingüinos. Hasta que Kowalski descubre su secreto. / Ahora que el Rey Julien proclamó que expulsará a todo aquél que le toque los pies, ¿podrá Mort salvarse?
Episodio 7 Mort desaparece en el hábitat de los ocupantes más recientes del zoológico. Ahora Kowalski tiene que pensar en un plan para recuperarlo. / Maurice come lichis malos que lo vuelven loco y le llenan la cabeza de poder.
Episodio 8 Son los pingüinos contra los lémures en una carrera de autos a medianoche en el zoológico. / Rico se traga una bomba de tiempo. Inmediatamente después, Alice le da su medicina: ¡Jarabe antivómito Arcada!
Episodio 9 El zoológico inicia la alimentación de pasteles de pescado de imitación por lo que los pingüinos deciden secuestrar uno de los camiones de reparto. / Es invierno y los pingüinos tradicionalmente juegan hockey, hasta que llegan las ratas.
Episodio 10 El doctor del zoológico está vacunando a los pingüinos, pero Skipper por cobardía, se rehúsa a ser vacunado. / Los monos querían que el Rey Julien no los hiciera bailar samba todos los días, así que engañan a Julien con un eclipse.
Episodio 11 El nuevo invento de Kowalski convierte a Mort en un gigante superfuerte. Ahora, el rey Julien tiene planes perversos para su musculoso súbdito. / La nueva compañera de cuarto de la pequeña Marlene es una morsa gigante.
Episodio 12 Las ratas asustaron a Roger, el yacaré, y él le pide ayuda a los pingüinos, quienes cambian el cerebro de Roger por el de Rico, para que la lucha comience. / El zoológico incorpora un robot para que aprenda los hábitos de los lémures.
Episodio 13 Marlene se aburre de estar en el zoológico, así que va con Skiper, los pingüinos y los lémures para hacer un plan de escape. / Max, el gato vuelve al zoológico, pero como fugitivo de un hombre policía.
Episodio 14 Rico recibe un mensaje muy extraño en su galleta de la fortuna, pero lo ignora. / Una mona llega al zoológico y Phill se enamora, pero por tener miedo no puede decirle lo que siente por ella.
Episodio 15 En su turno, Cabo ve una impresionante cielorca: una orca del cielo. Pero nadie cree en su historia. / Una ola polar ha caído en el zoológico y todos se congelan. Alice, con un científico vigilan a los pingüinos.
Episodio 16 Cuando los pingüinos salen del zoológico para hacer una buena obra, se topan con el oficial X. / Los muchachos son engañados por un aparente buen samaritano que se hace pasar por "El arquero".
Episodio 17 El archienemigo de Skipper, el Dr. Espiráculo, regresa con un malvado plan para acabar con los animales del zoológico.
Episodio 18 ¡El Rey Julien perdió su fandangosidad! (es decir, su ritmo). / Cuando un apagón amenaza la paz del zoológico, se necesitará de un líder fuerte para mantener todo bajo control. Pero tendrán que conformarse con el Rey Julien.
Episodio 19 Un zombie aparece en el zoológico y asusta a todos. Pero nadie se da cuenta de que, en realidad, el zombie es uno de los pingüinos. / Un enjambre de avispones pone un nido en pleno zoológico para picar a los niños cuando van de visita.
Episodio 20 Cuando Skipper sale de la camioneta de un noticiero, acaba sufriendo de "reportiamnesia" y cree que es el famoso reportero Chuck Charles. / Cuando Cabo bebe, por accidente, un frasco de suero de la verdad, cuenta secretos muy vergonzosos.
Episodio 21 Cuando Mort y Maurice rompen el trono real, el Rey Julien los destierra de su mitad del hábitat de los lémures. / Un pequeño sapo venenoso se muda al zoológico, pero tiene una actitud muy desagradable.
Episodio 22 Burt, el elefante, necesita que los pingüinos lo ayuden a escapar del zoológico para atravesar la ciudad y enmendar un daño que hizo hace muchos años. / El nuevo invento de Kowalski promete el amor perfecto para Marlene.
Episodio 23 ¿Será posible? Alice dice que uno de los pingüinos en realidad es... ¡hembra! / Mason ya no tolera el desorden de Phil, así que decide mudarse con los pingüinos.
Episodio 24 La nueva creación de Kowalski devora todo lo que encuentra a su paso (excepto peces). ¡Y crece con cada bocado! / Con el nuevo canal de animales tontos, la gente se queda en casa para ver trucos de animales.
Episodio 25 ¡Un maligno pez con cabeza de serpiente devora a Skipper! ¿Podrán los otros pingüinos rescatarlo o Skipper está condenado a ser digerido? / Un halcón hembra aterriza en el zoológico y Skipper se enamora de ella.
Episodio 26 Cabo el Adorable finalmente tiene competencia para salir en la portada del folleto anual del zoológico. / El enemigo de Skipper, Hans, aparece queriendo hacer enmiendas. Tal vez pueda engañar a los otros pingüinos.
Episodio 27 “Cuando Marlene pone un pie fuera del cautiverio, pierde el control y se convierte en una bestia salvaje.”
Episodio 28 “El oficial X del control de animales de la ciudad de Nueva York está tras Max, el gato callejero amigo de los pingüinos.”
Episodio 29 Phil intenta ganarse el corazón de una chimpancé visitante llamada Lulu.
Episodio 30 Los pingüinos deben deshacerse de la mirada vigilante de un científico entrometido antes de que tropiece con todos sus secretos.
Episodio 31 Una niña pierde su muñeca en el zoológico, y convencen a Rico de que entregue la suya para reemplazarla.
Episodio 32 Un misterioso bandido está robando a los animales del zoológico sus pertenencias más queridas.
Episodio 33 Julien se horroriza cuando la rutina de baile de los babuinos recibe más atención que la suya.
Episodio 34 Un apagón en el zoológico lleva las delirantes ideas de gobierno del rey Julien a un nivel completamente nuevo.
Episodio 35 Los otros pingüinos temen que Skipper se haya convertido en un zombi después de una visita al veterinario.
Episodio 36 Unos avispones nada amistosos planean picar a cualquiera que entre al zoológico.
Episodio 37 Tras un percance con Julien, Maurice y Mort son desterrados de su reino.
Episodio 38 Una diminuta rana con muy mala actitud llega al zoológico y comienza a aterrorizar a los demás animales.
Episodio 39 Tras una pelea, los pingüinos les muestran a Mason y a Phil cuánto se necesitan el uno al otro.
Episodio 40 Skipper entra en una crisis de identidad cuando Alice menciona que uno de los pingüinos en realidad es hembra.
Episodio 41 Burt, el elefante, les pide a los pingüinos que lo ayuden a escapar del zoológico.
Episodio 42 Marlene alcanza a ver a Fred, la ardilla, y se enamora a primera vista.
Episodio 43 Los animales hacen un comercial para promocionar el zoológico después de que un nuevo canal de televisión los deja obsoletos.
Episodio 44 Cuando un pez gigante aterroriza el estanque de los patos, Skipper lidera una misión para eliminar la amenaza.
Episodio 45 Kowalski crea accidentalmente una masa de gelatina viviente… con un gran apetito.
Episodio 46 Cuando una hermosa halcona se estrella en el zoológico, Skipper insiste en que se quede.
Episodio 47 Cabo se molesta cuando Mort es elegido como el animal de portada del folleto del zoológico.
Episodio 48 Cuando su archienemigo, el Dr. Blowhole, secuestra al rey Julien y amenaza con derretir el Círculo Ártico, los pingüinos deben detenerlo, pero caen en una astuta trampa.
Tom McGrath
Skipper (voice)
Jeff Bennett
Kowalski (voice)
James Patrick Stuart
Private (voice)
John DiMaggio
Rico (voice)
Danny Jacobs
King Julien XIII (voice)
Kevin Michael Richardson
Maurice (voice)
Andy Richter
Mort (voice)
Nicole Sullivan
Marlene (voice)