"Superman: La serie animada" es protagonizada por Superman y forma parte del mismo universo de "Batman: La serie animada", "Batman del futuro", "Liga de la Justicia" y "Liga de la Justicia Ilimitada". A diferencia de otras versiones, esta serie no está dirigida a un público infantil, pues las aventuras no tienen un "mensaje" y los personajes no son unidimensionalmente "buenos" o "malos". La acción tiene un buen grado de violencia, y en más de una ocasión hay personajes que son asesinados o condenados a la pena de muerte. El protagonista principal es Superman, y lo acompañan sus padres adoptivos Johnatan y Marta Kent. A Clark Kent lo acompañan sus compañeros periodistas Louis Lane, Jimmy Olsen y Perry White. Con los villanos, destacan Lex Luthor, en su versión de empresario; Darkseid y los habitantes de Apokolips. Además, aparecen numerosos personajes invitados, como Batman, Flash, Dr. Destino, Aquaman, Linterna Verde (Kyle Rayner), entre otros.
Episodio 1 Superman descubre en su nave un proyector que le muestra la Zona fantasma y en ella conoce a Mala, una Kryptoniana que ya cumplió su condena, Superman decide liberarla e integrarla a la vida en Metropólis, pero su sed de poder puede más que ella, entonces Superman decide devolverla a la zona fantasma, Mala escucha este plan y escapa liberando a otro Kryptoniano de la zona fantasma, el General Jax-Ur.
Episodio 2 El general Jax-Ur y Mala aterrorizan Metrópolis, cuando Superman intenta hacerles frente, le tienden una trampa secuestrando a Lois Lane y lo envían a la Zona Fantasma destruyendo el proyector, que es la única forma en la que podría volver Superman. Con Superman fuera de su camino los Kryptonianos empiezan su conquista en la Tierra, el profesor Hamilton construye otro proyector y logra sacar a Superman de la zona Fantasma.
Episodio 3 Mientras Superman intenta detener un meteoro encuentra una criatura que se alimenta de energía y pone en peligro Metropolis al aterrizar en ella.
Episodio 4 Flash y Superman compiten en una carrera benéfica, cuando descubren la amenaza de un villano conocido como El mago del tiempo, los superhéroes abandonan la carrera para detener al enemigo.
Episodio 5 Una locutora radial que difundía una campaña contra Superman recibe una descarga eléctrica proveniente de un rayo junto a Superman, lo cual la convierte en pura energía eléctrica.
Episodio 6 Clark Kent tiene un accidente y es rescatado nada más y nada menos que por Superman, luego descubre que se trata de Bizarro, un fallido clon que Lex Luthor creó.
Episodio 7 Lois Lane sufre un atentado contra su vida cuando recibe un premio, al ser salvada por superman, intentará averiguar quien la odia tanto como para querer matarla.
Episodio 8 Superman recibe la visita de un pequeño ser de otra dimensión llamado Mxyzptlk que le reta a obligarlo a pronunciar su propio nombre para que no le juegue sus bromas.
Episodio 9 Metallo reaparece en una isla y conoce a dos niños, al principio no recuerda su origen. A Metrópolis llega el rumor de la aparición de un robot por lo que Lois Lane y Superman van a investigar.
Episodio 10 Alto voltaje escapa de su encierro y libera a Parásito para que juntos acaben con Superman.
Episodio 11 Edward Lytener, quien quiso asesinar a Lois Lane ha escapado de prisión y decide continuar su venganza y esta vez usando unos satélites ha logrado filtrar los rayos solares, dejando a Superman cada vez con menos poderes.
Episodio 12 El profesor Hamilton crea un portal hacia otra dimensión, por accidente Lois Lane viaja a una dimensión donde Metrópolis se ve hundida en un desastre por que el Superman de esa dimensión ha decidido coquistar la ciudad.
Episodio 13 Veinte años atrás Lois Lane tenía una amistad con un simio entrenado para pilotar una nave espacial, en su misión el simio se pierde en el espacio. En el presente Superman encuentra la nave perdida con el simio dentro, pero al llevarlo a Metrópolis descubren que el simio ha sido afectado por la radiación.
Episodio 14 Brainiac esta de regreso, pero solo como información, por lo que obliga a Lex Luthor a construir un cuerpo físico para él, Superman al notar la ausencia de Lex descubre a Brainiac y su plan para volver.
Episodio 15 En Apokolips Kalibak, hijo de Darkseid, quiere demostrar su valor, por lo que va a la tierra para derrotar a Superman como favor para su padre, aun cuando Darkseid se lo había prohibido, mientras tanto en Metrópolis los padres de Clark Kent están de visita.
Episodio 16 El Joker ha robado una reliquia hecha de Kryptonita, luego le propone a Lex Luthor acabar con Superman por un millón de dólares, por lo que Batman decide ir a Metrópolis a seguir su rastro, aquí se produce el encuentro de Batman y Superman.
Episodio 17 Mientras que Bruno Diaz (Bruce Wayne, en el original) empieza una relación con Lois Lane, Batman salva a Superman del Joker quien le había tendido una trampa usando la Kryptonita, Lex Luthor reclama a Joker su fracaso y le da una última oportunidad para acabar con Superman.
Episodio 18 Con las armas que Lex Luthor a proporcionado a Joker separan a Superman de Batman, para que así el Joker acabe con Batman primero sin la intervención de Superman, pero aun así los superhéroes logran vencerlos. Cuando el Joker y Lex Luthor rompen su negociación el Joker secuestra a Lex para mostrarle como destruye Metrópolis, entonces Superman y Batman unen fuerzas para detenerlo.
Episodio 19 Un Demonio llamado Karkull ataca Metrópolis luego de que escapara de su encierro, con poderes que Superman no puede combatir, el héroe se ve obligado a pedir ayuda a Destino (Doctor Fate), pero éste se muestra desinteresado.
Episodio 20 Cuando Bizarro descubre la Fortaleza de la soledad de Superman y ve como fue el planeta natal de Superman decide convertir Metrópolis en un nuevo Krypton para después hacerlo explotar tal como el original.
Episodio 21 Lex Luthor y John Henry Irons diseñan un prototipo de armadura, pensada para ser usada por las fuerzas militares, en una demostración el Sargento Mills, quien es elegido para usar la armadura, ayuda a Superman a salvar unas personas atrapadas en un incendio, pero el Sargento es corrompido por la armadura perdiendo la cordura y volviéndose una amenaza.
Episodio 22 Clark Kent sufre un accidente investigando el caso de un hombre a punto de ser ejecutado que jura inocencia, las circunstancias del accidente hacen creer a todos que Clark Kent ha muerto, como Superman tiene que continuar con el caso para salvar a un hombre inocente, pero se muestra preocupado por ya no poder usar la identidad de Clark Kent.
Episodio 23 John Henry Irons, quien había renunciado a LexCorp decide perfeccionar por su cuenta la armadura que creó anteriormente, para probar una pieza de ella intenta detener a unos ladrones, luego es ayudado por Superman quien descubre que uno de los ladrones es Metallo quien usando su corazón de Kryptonita deja malherido a Superman, entonces Irons decide probar toda la armadura y se convierte en "Steel" haciéndole frente a Metallo mientras Superman se recupera.
Episodio 24 Máxima, reina del planeta Almerac, viene a la Tierra en busca de Superman para convertirlo en su esposo, a la fuerza si es necesario.
Episodio 25 Intergang está recibiendo armas de alta tecnología provenientes de Apokolips, capaces de lastimar incluso a Superman. Aparece Orión para advertirles de la inminente invasión por parte de Darkseid a la tierra.
Episodio 26 La invasión de Darkseid llega a su punto culminante cuando este derrota y toma como prisionero a Superman. La intervención del ejército de Nuevo Génesis salva a la Tierra de ser conquistada, pero antes de retirarse, Darkseid asesina a Dan Turpin para enfurecer a Superman.
Episodio 27 Explorando los restos de su planeta Krypton, Superman encuentra a una sobreviviente de su planeta gemelo, una jovencita llamada Kara In-Ze. Pronto la joven empieza a desarrollar los mismos poderes de Superman, pero este no le permite unirse a él y ayudarle.
Episodio 28 Aún contra los deseos de Superman, los dos deben hacer equipo cuando descubren que Darkseid tiene un plan para destruir la Tierra sin violar su tregua con Nuevo Génesis.
Tim Daly
Superman / Clark Kent (voice)
Dana Delany
Lois Lane (voice)
