Un malvado mago transporta a un joven guerrero samurái al futuro, donde inicia una búsqueda para regresar al pasado y deshacer los daños causados; en su camino, conseguirá algunos aliados que lucharán contra los secuaces del mago.
Episodio 1 Jack le enseña a una tribu pacífica a defenderse de los ataques de tribus enemigas, para que él pueda tomar lecciones sobre como "saltar bien" (Saltar lo suficientemente alto como para alcanzar a Aku).
Episodio 2 Este episodio muestra tres historias cortas sobre algunos encuentros de Jack. Uno es con un gusano gigante de dos cabezas, otro es con una familia que se alimenta de metal, y en el último Jack trata de rescatar a un hada de una gárgola.
Episodio 3 Jack debe defenderse por su cuenta en la "Cúpula del Juicio"
Episodio 4 El Hombre Escocés requiere la ayuda de Jack para que lo ayude a rescatar a su esposa, que está prisionera en un castillo.
Episodio 5 Luego de que Jack pasara por varias ciudades destruidas, trata de detener a los 8 robots responsables de la destrucción, con la ayuda del profesor que inicialmente los creó.
Episodio 6 Jack regresa al lugar donde vivió y nació, donde recuerda su niñez.
Episodio 7 Jack busca la verdad subiendo la "Montaña de Fatoom" junto a tres monjes.
Episodio 8 Jack llega a un pueblo infestado con un aliento que viene de una cueva. Jack, tras investigar, se da cuenta de que el aliento viene de un dragón con una fuerte indigestión.
Episodio 9 Aku recluta a los cazadores Imagandi para capturar a Jack.
Episodio 10 Jack pelea contra Demongo (un sirviente de Aku) y su tropa de guerreros de ultratumba.
Episodio 11 Jack debe ir en búsqueda de un conejo que robó su espada y ropa, mientras oculta su desnudez poniéndose diferentes ropas las cuales le acarrean problemas de identidad confundida.
Episodio 12 Jack, mientras sube hacia el pico de una gran montaña se encuentra con un grupo de 300 guerreros. Jack les ofrece su ayuda en la última etapa de cinco generaciones de guerra.
Episodio 13 Un grupo de robo-motociclistas destroza las sandalias de Jack, que por su parte debe ir en busca de algo que pueda ponerse para sus pies.
Phil LaMarr
Samurai Jack (voice)
Greg Baldwin
Aku (voice)
Tara Strong
Ashi (voice)
Grey DeLisle
The High Priestess (voice)
