En esta temporada, Sakura regresa de las vacaciones de verano y sigue recolectando las Cartas Clow faltantes. Sin embargo, la trama de la serie se torna más oscura, siempre encaminándose hacia el desenlace durante el Juicio Final.
Episodio 1 Sakura tiene un extraño sueño en el que ella está parada sobre un edificio y hay una mujer parada en la Torre de Tokio. En la escuela descubren que su nueva profesora es la señorita Mizuki, quien le dice a Sakura que cosas hermosas caerán del cielo. En ese momento empieza a nevar.
Episodio 2 En la escuela Tomoyo ensaya con el Coro para una competencia que tendrán en la ciudad, Sakura la espera para salir juntas, pero cerca está la Profesora Misuki, quien misteriosamente le advierte a Sakura que tenga mucho cuidado, pues ella o sus amigos pueden correr peligro. Mientras Tomoyo cantaba, Sakura siente la presencia de una Carta Clow, al parecer es Tomoyo quien corre peligro; segundos después la Pequeña deja de Cantar, al parecer la carta de le ha robado su hermosa voz
Episodio 3 El grupo de Sakura tendrá el día de recolección de fresas. Sin embargo a la hora del almuerzo algo extraño pasa, la puerta del Auditorio no se puede abrir.
Episodio 4 Sakura se levanta con fiebre. Le pide a su hermano que no diga nada para que su padre no se preocupe. Ella va a la escuela pero Tomoyo la lleva a la enfermería. La enfermera le pide que descanse y la envía a casa. Allí Sakura se percata de una carta Clow. Su hermano la recoge y la lleva. Sakura utiliza una vez más a la carta Espejo que la suplanta mientras ella va a capturarla.
Episodio 5 Sakura, Tomoyo, Li y Meilin van juntos a la Capital para comprar algunas cosas y conocer la imponente Torre de Tokio. Los chicos se divierten visitando tiendas de Música y Ropa. Aunque ellos no se percatan, muy cerca ha estado una Mariposa Azul que los sigue a todos lados, y cuando se aproxima demasiado hace que los chicos tengan extrañas ilusiones
Episodio 6 El grupo de Sakura preparará una obra teatral, “La bella durmiente del Bosque”. Para decidir los papeles de cada chico la Profesora Misuki realiza un divertido sorteo, Sakura y Shaoran tienen los papeles Principales, pero a Sakura le toca ser y el Príncipe y a Shaoran la Princesa
Episodio 7 La tan esperada Obra “La bella durmiente del bosque” que realizara el grupo de Sakura se presenta en el auditorio. Todo comienza perfectamente hasta la escena más emocionante de la obra. La princesa yacía dormida en su castillo y el Príncipe estaba a punto de darle un beso para despertarla. Sin embargo, justo en ese momento todo se oscurece con gran rapidez y las personas que estaban en el auditorio desaparecen por completo
Episodio 8 Meilin está algo triste, al parecer ha recibido una llamada que no trae buenas noticias, su madre desde Hong Kong le pidió que regresara a casa en una semana. Sakura se siente muy triste al ver a Meilin tan cabizbaja y decide invitarla a su casa para hablar con ella y tratar de reanimarla.
Episodio 9 De nuevo Sakura tienen ese extraño sueño, pero cada vez se hace más claro, se ve una enorme Luna llena, la Torre de Tokio y la Profesora Misuki, pero esta vez hay alguien más, es un sujeto con grandes Alas. Al día siguiente Sakura, Shaoran y Tomoyo van a una competencia de Arquería donde participará el joven Yukito. Yukito es un gran arquero, pero hay alguien que no se queda atrás; las finales se realizan entre en hábil Yukito y la misteriosa Profesora Misuki
Episodio 10 La carta Tierra, la última carta Clow aparece, esta poderosa carta especial está resquebrajando el suelo, todas las personas en la ciudad están muy asustadas, así que Sakura decide usar la carta de “El Sueño” para dormirlos a todos y así poder enfrentarse a la carta sin ser molestada o vista por alguien
Episodio 11 Yue inicia el juicio, Shaoran ya había sido vencido es el turno de la Card Captor elegida por Kerberos, Yue traslada a Sakura hacia un lugar cercano a la torre de Tokio, el mismo lugar que Sakura veía en sus sueños
丹下桜
Sakura Kinomoto (voice)
岩男潤子
Tomoyo Daidouji (voice)
くまいもとこ
Syaoran Li (voice)
Aya Hisakawa
Kerberos (voice)
篠原恵美
Naoko Yanagisawa (voice)
Hideyuki Tanaka
Fujitaka Kinomoto (voice)
小野坂昌也
Kerberos(big) (voice)
緒方恵美
Yukito Tsukishiro (voice)
Tomokazu Seki
Touya Kinomoto (voice)
ゆかな
Meiling Li (voice)
Rinko Kawakami
Rika Sasaki (voice)
佐々木望
Eriol Hiiragizawa (voice)
