Leonardo, Raphael, Michaelangelo y Donatello deben salvar la ciudad de Nueva York del malvado señor del crimen Shredder y su asistente, Baxter Stockman. Las tortugas deben luchar contra los soldados de infantería, los ratones y las pandillas y obtener ayuda de su sensai Splinter, su amiga April O'Neil y su compañero Casey Jones en una nueva serie llena de acción.