En un laboratorio remoto en una isla solitaria, vive Shiki Magata, una programadora prodigio aislada desde su adolescencia. El profesor adjunto Sohei Saikawa y su alumna Moe Nishinosono desean conocerla, pero se ven involucrados en una escena del crimen. Aunque nadie parece haber ingresado a la habitación de Shiki, allí yace su cadáver, con un vestido de novia y las extremidades amputadas. Así, Saikawa y Moe comienzan a investigar este misterioso asesinato en una habitación cerrada. Sin embargo, con el peligro acechando, este podría ser el último misterio que intenten resolver.