La Invasión de los Vexos

Luego de tres años, la paz de Nueva Vestroia no dura mucho tiempo. Una raza alienígena llamada los Vestals (liderado por su Rey Zenoheld), empezaron a invadir y colonizar Nueva Vestroia, convirtiendo a los Bakugans en esferas y haciéndolos sus esclavos para la diversión, sin saber que los Bakugan son criaturas inteligentes. Uno a uno los seis Bakugan son capturados dejando solo a Drago. Ahora es la última esperanza para Nueva Vestroia, Drago es separado de la base perfecta de los seis guerreros legendarios, y se dirige a la Tierra para buscar a su viejo amigo Dan Kuso. Después de escuchar el plan, Neo Dragonoid decide dejar a Runo y a Julie detrás y se abre el portal para llegar a Nueva Vestroia.